液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)鑒定rLTB的結(jié)構(gòu)
摘要:目的利用電噴霧離子化為接口(ESI)的液相色譜/質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)(HPLC—MS),鑒定重組大腸桿菌不耐熱腸毒素B亞單位(rLTB)氨基酸序列結(jié)構(gòu)的正確性。方法利用SDS—PAGE分離、呈現(xiàn)蛋白混合物,胰蛋白酶原位水解rLTB.HPLC—MS聯(lián)機制備肽指紋圖,分析肽指紋圖獲得rLTB氨基酸全序列信息。結(jié)果 rLTB的全序列結(jié)構(gòu)與理論的全序列結(jié)構(gòu)*一致。結(jié)論改進的HPLC—MS測定條件穩(wěn)定,提高了質(zhì)譜靈敏度,結(jié)合肽指紋圖的分析結(jié)果,可以驗證蛋白質(zhì)的氨基酸序列。
關(guān)鍵詞:rLTB;原位酶解;HPLC—MS;肽;指紋圖譜
The Structure Identification of rLTB by HPLC-MS
YANG Jun,TIANG Wen—Biao,ZHU Yong—Hong,ZOU Quan—Ming
(Department of Clinical Microbiology,3bird Military Medical University,Chongqing 400038 China)
ABSTRACT:Aim 3he correcTESS of the primary structure of recombinant heat—labile enterotoxin B was identified by liquid chromatography/electrospray ionization mass spectrometry.Methods rLTB in SDS— PAGE gel was digested by trypsin,an d its peptide finger mapping Was m pared by improved HPLC—MS methods.By an alyzing peptide finger mapping,the primary structure of rLTB Was identified .Results: 3heoretic an d actual primary structure of rLTB is consistent.Conclusion Improved HPLC — MS conditions were stable.3he sensitivify of MS Was increased .Whole amino acid sequence of proteins were detected .
KEYWORDS:rLTB;Tryptic digestion in gel;HPLC—MS;Peptide finger ma pping
大腸桿菌不耐熱腸毒素(heat—labile enterotoxin,LT)是產(chǎn)毒素性大腸桿菌(enterotoxigenic E.coli,ETEC)分泌的一種熱不穩(wěn)定性腸毒素,由A、B二個亞單位組成,其中A亞單位通過其GTP依賴的ADP一核糖基化轉(zhuǎn)移酶活性引發(fā)毒素效應(yīng),B亞單位可以與真核細胞表面的GM1一神經(jīng)節(jié)苷脂受體特異結(jié)合,幫助A亞單位進人細胞,結(jié)合到靶細胞上。由于LT的B亞單位(LTB)的毒性低,粘膜免疫佐劑活性高,在口服蛋白疫苗研究中,作為誘導(dǎo)機體產(chǎn)生粘膜免疫反應(yīng)的佐劑,引起廣泛的興趣。
8O年代末二種軟電離技術(shù)的發(fā)明,使質(zhì)譜邁人了生物大分子的研究領(lǐng)域,并極大地推動了蛋白組研究進程。其中一種軟電離技術(shù)是電噴霧離子化(eleetrospmy ionization,ESI),ESI能產(chǎn)生多電荷峰擴大了分子量的測定范圍,同時提高了靈敏度和準確性。HPLC能分離得到較多的蛋白滿足后續(xù)的鑒定,與質(zhì)譜(MS)直接連接使用自動化程度高、重復(fù)性好?;谶@些優(yōu)點,隨著HPLC—MS的發(fā)展和改進,成為了蛋白組學(xué)研究的核心技術(shù)。利用DNA重組技術(shù)將LTB基因通過合適的載體克隆到易于操作和培養(yǎng)的宿主細胞中進行表達,再分離純化表達產(chǎn)物,即rLTB。驗證rLTB氨基酸全序列的正確性是基因工程產(chǎn)品質(zhì)量控制的重要指標(biāo)。肽圖譜(peptide mapping)是蛋白質(zhì)經(jīng)水解后測定肽段以獲得相關(guān)的信息,是生物制品高特異的鑒定方法。目前主要有液相肽圖和質(zhì)譜肽圖,前者根據(jù)肽段在色譜柱上的分離行為差異而獲得,主要檢測蛋白質(zhì)制品的穩(wěn)定性,后者經(jīng)色譜柱分離后通過質(zhì)譜分析每個肽段的準確分子量,從而鑒定蛋白質(zhì)的初級結(jié)構(gòu)。色譜分離蛋白質(zhì)和肽zui常用zui有效的流動相體系是乙腈、水和三氟乙酸,但對于電噴霧質(zhì)譜(ESI—MS),三氟乙酸根是具有強離子對效應(yīng)的陰離子,與質(zhì)子化肽段生成電中性的離子對,抑制多肽ESI—MS的質(zhì)譜信號。本文采用了改進色譜條件,直接HPLC—MS聯(lián)機檢測,獲得rLTB的HPLC肽圖和Ⅲ,LC/MS肽圖并驗證了rLTB的氨基酸全序
列結(jié)構(gòu)。
1 材料與方法
1.1 試劑與儀器:色譜純乙腈、三氟乙酸(TFA)、乙酸(均為美國TEDIA公司產(chǎn)品);超純水的電阻率為18.2MI2;胰蛋白酶[(經(jīng)11PICK處理)為Promega公司];rLTB(由本教研室純化組提供,批號011205)。其余試劑均為分析純。流動相A:1000ml超純水。流動相B:乙腈800ml和水200ml。胰蛋白酶溶液:用緩沖液將胰蛋白酶配制成1mg/ml 的溶液。1100HPLC/1946B型液質(zhì)聯(lián)用儀:在線脫氣機、四元梯度泵、自動進樣器、柱溫箱、光二極管陣列紫外可見分光光度檢測器、ESI接口的四極質(zhì)譜檢測器(均為Agilent公司)。色譜柱Zorbax 300SB.C18(5tan,2.1mm×150mm);保護柱Zorbax 300SB.C18(5μ,2.1mm×12.5mm,均為Agilent公司)。
1.2 方法
1.2.1 SDS—PAGE電泳條件:采用15%分離膠,5%濃縮膠,rLTB上樣量10μg,聚集電壓80V,lh,分離電壓65V,3h??捡R斯亮藍染色。
1.2.2 胰蛋白酶水解方法:用刀片從電泳膠上切下目的蛋白帶,將其切成1mm2大小的膠塊。放人含有50% 乙腈,50mmol/L 的NH4HC03溶液中,搖床上25Or/rnin,20min震蕩清洗,重復(fù)三次。將膠片置鼓風(fēng)干燥機中70℃干燥,30min。加人2O 酶溶液和2O 的50mmol/L 的NH4HC03溶液,蓋上塞,輕搖,37℃水浴18h。取出加人乙酸2Oμl 終止反應(yīng)。
1.2.3 酶水解產(chǎn)物的HPLC—MS分析:將1.3.2處理過的樣品經(jīng)0.45μm孔徑的濾膜濾過待用。HPLC色譜條件:流動相A和B;洗脫梯度B相從0%—60% ,25min;保護柱和色譜柱;柱溫40℃ ;流速0.25ml/min;上樣量1Oμl ;檢測波長分別為210nm。質(zhì)譜條件:干燥氣流速,12 l/min;輔助霧化氣壓力,40Pa;干燥氣溫度,350℃;電噴霧電壓,4 000V;m/z掃描范圍5O~3 000;裂解電壓,120V;質(zhì)譜掃描間隔0.20Da;掃描周期0.97s。
2 結(jié)果
2.1 rLTB的SDS—PAGE電泳和原位酶解:rLTB以包涵體的形式表達,通過包涵體溶解和二步純化工藝處理,SDS—PAGE電泳分析rLTB純化產(chǎn)品的純度,見圖1。rLTB的分子量為14 100,圖1箭頭所指的條帶為rLTB,其純度約86%。從圖中可見rLTB純化產(chǎn)品約有6~7條雜蛋白帶。用小刀切下箭頭所指的rLTB條帶,按1.2.2方法進行原位酶解。
2.2 rLTB原位酶解結(jié)果分析:經(jīng)TPCK處理的胰蛋白酶專一性酶切位點在肽鏈中K(LyS)和R(nrg)
的羧基端,水解后蛋白產(chǎn)生長短不等的肽段。rLTB理論氨基酸全序列見圖2,共有124個氨基酸,含有16個精氨酸和賴氨酸,胰蛋白酶水解后理論上可以產(chǎn)生17個肽段或氨基酸。圖2中T1-17為17個肽段的編號及所在位置,標(biāo)在每個肽段的羧基端。
2.3 酶水解產(chǎn)物的HPI_E—MS分析結(jié)果:在分離多肽混合物時,一般在流動相中加入TFA(A相0.1% ,B相0.085%),可以獲得較好的色譜分離效果。但在液質(zhì)聯(lián)機中TFA會抑制多肽的ESI質(zhì)譜信號,見圖3。圖3A、3B分別為流動相中添加TFA的色譜肽圖和質(zhì)譜肽圖,圖3A液相肽圖中可見胰蛋白酶水解的肽段得到較好的分離,而圖3B質(zhì)譜肽圖的樣品信號幾乎*被抑制了。圖3C、3D為用乙酸(A相0.1%,B相0.1%)代替TFA添加到流動相中的液相肽圖和質(zhì)譜肽圖。圖3c液相肽圖中峰的數(shù)目和保留時間與圖3A液相肽圖中基本一致,同時獲得很好的質(zhì)譜肽圖見圖3D。
2.4 rLTB質(zhì)譜肽指紋圖的鑒定分析:從圖3D中提取各肽段質(zhì)量數(shù),進行肽段歸屬鑒定分析。表1列出rLTB胰蛋白酶水解所得肽段的實測質(zhì)量數(shù)和理論質(zhì)量數(shù),以及二者之間的誤差。
3 討論
HPLC -MS聯(lián)機技術(shù)結(jié)合酶解可以檢測蛋白質(zhì)的氨基酸全序列,但對待測蛋白質(zhì)的純度要求較高(一般要求達到98%以上)。rLTB包涵體溶解后,經(jīng)過二步純化,其純度雖然達到85% 以上,仍不能滿足液質(zhì)聯(lián)機氨基酸序列分析的要求。考慮到雜蛋白較少,見圖1,SDS—PAGE一維電泳對其分離即可達到目的。我們采用SDS—PAGE上的原位酶解方法,即在凝膠中將rLTB水解成多個肽段,分子量較小的肽段容易離開聚丙烯酰胺的膠孔到溶液中。該方法蛋白質(zhì)的水解充分,所得肽段的濃度較高,通過HPI_E—MS制備出較好的肽指紋圖。
蛋白質(zhì)或多肽的色譜分離常在流動相中加入TFA,改善了色譜的分離效果,卻抑制質(zhì)譜信號,這對矛盾的存在,使HPLC—MS在蛋白質(zhì)分析方面并不是一個的組合,有報道在液相檢測器和電噴霧離子化室之間用“TFA—rEX”的柱后修飾可以極大地提高質(zhì)譜檢測的靈敏度。但是“TFA—fix”修飾需要一臺高精度的溶劑添加泵,增加了檢測程序和檢測成本。為此本文改變液相流動相的條件,選擇不具有強離子對效應(yīng)的有機酸代替TFA,可以同時獲得良好的色譜和質(zhì)譜指紋圖。通過比較不同比例的甲酸和乙酸,zui后篩選出在A、B流動相中分別加入0.I%的乙酸,達到較好的HPLC—MS檢測效果。該方法簡化了HPLC—MS檢測步驟,彌補HPLC—MS在蛋白質(zhì)分析方面的局限,可以同時獲得較好的色譜和質(zhì)譜肽指紋圖,并通過質(zhì)量數(shù)鑒定分析獲得目的蛋白的氨基酸序列結(jié)構(gòu)。
參考文獻:
[1]Ciplak W Jr,Messser RJ,KonkelME,et a1.Role of a potential endoplasmic reticulum retention seluence(RDEL)and the Gotsi complex in the eytotonie activity of Eacherichia cob heat— labile enterotoxin lJj.MolMicrobiol,1995,16(4):789
[2] Nashar-TO,Webb-l-lM,Eaglestone-S,et a1.Potent rmnmnogenicity of the B subtmits of Escherichia coli heat-labile enterotoxin:receptor bindingis essential and induces diferential modulation of lymphocyte subsetslJj.Proc-Natl-Acad.sc - sA,1996,93(1):226
[3] Zhou H,Watts J D,Aebersold R.A systematic approach to the znalysis of protein phosphorylation[J].Nat Biotechnol,2001,19:375
[4] 中國生物制品標(biāo)準化委員會.中國生物制品規(guī)程[S].北京:化學(xué)工業(yè)出版社,2000.1 45
[5] 陳執(zhí)中,章月華.現(xiàn)代生化藥物與基因工程藥物分析[M].上海:上海醫(yī)科大學(xué)出版社,2000.18—27
[6] R.M.K~,np,T.Choli—Papad 0Il,B.Witunann—Liebold.Potein Structure Analysis:P~pal'ation,Characterization and Microsequencing lJj.Berlin:Springer—VerlagBerlinHeidelberg,1997,199