PCR技術(shù)的本質(zhì)是核酸擴(kuò)增技術(shù)，重復(fù)“變性(denature)→退火(anneal)→引物(primer)延伸(extension)”過程至25-40個(gè)循環(huán)，呈指數(shù)級(jí)擴(kuò)大待測樣本中的核酸拷貝數(shù)，達(dá)到體外擴(kuò)增核酸序列的目的。

 PCR的基本原理：

在PCR技術(shù)的發(fā)展過程中，熱穩(wěn)定DNA聚合酶的發(fā)現(xiàn)以及溫度循環(huán)的自動(dòng)化大大簡化了PCR程序，使PCR的自動(dòng)化成為可能，并在此基礎(chǔ)上不斷發(fā)展和改進(jìn)。
PCR基因擴(kuò)增儀的工作原理：
    PCR基因擴(kuò)增儀工作關(guān)鍵是溫度控制。
1.水浴鍋控溫：以不同溫度的水浴鍋串聯(lián)成一個(gè)控溫體系。
2.壓縮機(jī)控溫：由壓縮機(jī)自動(dòng)控溫，金屬導(dǎo)熱，控溫較第一代PCR基因擴(kuò)增儀方便，但壓縮機(jī)故障率高，邊緣效應(yīng)及溫度overshooting現(xiàn)象嚴(yán)重。
3. 半導(dǎo)體控溫：由半導(dǎo)體自動(dòng)控溫，金屬導(dǎo)熱，控溫方便，體積小，相對穩(wěn)定性好。
4. 離心式空氣加熱控溫：由金屬線圈加熱，采用空氣作為導(dǎo)熱媒介，溫度均一性好，各孔擴(kuò)增效率高度一致，滿足熒光定量PCR的高要求。
PCR擴(kuò)增儀的分類與結(jié)構(gòu)：
    PCR擴(kuò)增儀的種類總體來說，可以分成兩大類，即普通PCR擴(kuò)增儀和實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增儀。
1、 普通PCR擴(kuò)增儀
1）.普通PCR擴(kuò)增儀即通常所謂的定性PCR擴(kuò)增儀。
2）.梯度PCR儀是由普通PCR儀衍生出的帶梯度PCR功能的基因擴(kuò)增儀。
3）.原位PCR儀是由普通PCR儀衍生出的帶原位擴(kuò)增功能的基因擴(kuò)增儀。
2、 實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增儀
1.金屬板式實(shí)時(shí)定量PCR儀，還可作為普通PCR儀使用，有的甚至帶梯度功能，可容納的樣本量大，無需特殊耗材，但溫度均一性欠佳，有邊緣效應(yīng)，標(biāo)準(zhǔn)曲線的反應(yīng)條件難以做到與樣品wan全一致。
2.離心式實(shí)時(shí)定量PCR儀的PCR擴(kuò)增樣品槽被設(shè)計(jì)為離心轉(zhuǎn)子，溫度均一性好，但可容納樣品量少，有的需用特殊毛細(xì)管作樣品管，增加了使用成本，也不帶梯度功能。
3.各孔獨(dú)立控溫的定量PCR儀的不同樣品槽分別擁有獨(dú)立的智能升降溫模塊，各孔獨(dú)立控溫，適合多指標(biāo)快速檢測，可實(shí)現(xiàn)任意梯度反應(yīng)，但上樣不如傳統(tǒng)方法方便，而且需要du特的扁平反應(yīng)管，使用成本較高。