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RNA逆轉(zhuǎn)錄試劑盒操作步驟及實(shí)驗(yàn)原理
RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn)原理
RNA逆轉(zhuǎn)錄是通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄酶將RNA模板(如mRNA)轉(zhuǎn)化為互補(bǔ)DNA(cDNA)的過(guò)程,其核心原理是逆轉(zhuǎn)錄酶以RNA為模板,在引物(如Oligo dT或隨機(jī)引物)引導(dǎo)下合成cDNA鏈?。該技術(shù)廣泛應(yīng)用于基因表達(dá)分析、病毒檢測(cè)等領(lǐng)域,其關(guān)鍵步驟包括:
引物結(jié)合?:Oligo dT引物結(jié)合mRNA的Poly(A)尾,或隨機(jī)引物結(jié)合RNA任意區(qū)域?。
cDNA合成?:逆轉(zhuǎn)錄酶在42-50℃下催化dNTPs聚合,形成cDNA鏈?。
酶失活?:高溫(85℃)終止反應(yīng),防止酶活性干擾后續(xù)實(shí)驗(yàn)?。
試劑盒操作步驟
以常見試劑盒為例,操作流程如下:
1. ?RNA準(zhǔn)備?
質(zhì)量檢測(cè)?:通過(guò)電泳確認(rèn)RNA完整性(28S/18S條帶比例2:1)?。
去基因組DNA?:使用DNase處理RNA,避免gDNA污染?。
2. ?反應(yīng)體系配制?
冰上操作?:防止RNA降解?。
加樣順序?:
加入RNA模板(100pg-2μg)?。
加入逆轉(zhuǎn)錄酶、dNTPs及緩沖液(比例參考試劑盒說(shuō)明)?。
輕彈混勻后瞬離,避免氣泡?。
3. ?逆轉(zhuǎn)錄程序?
退火?:25℃孵育5分鐘(引物結(jié)合)?。
延伸?:42℃反應(yīng)15-60分鐘(cDNA合成)?。
酶失活?:85℃加熱5分鐘終止反應(yīng)?。
4. ?產(chǎn)物保存?
cDNA可短期保存于-20℃,長(zhǎng)期保存于-80℃?。
注意事項(xiàng)
RNA質(zhì)量?:降解或污染的RNA會(huì)導(dǎo)致cDNA產(chǎn)量低?。
引物選擇?:
Oligo dT適用于真核mRNA,隨機(jī)引物適用于原核或降解RNA?。
溫度控制?:復(fù)雜RNA(如高GC含量)需65℃預(yù)變性5分鐘?。
常見問題解決
cDNA濃度低?:檢查RNA完整性或增加模板量?。
gDNA污染?:使用DNase處理或設(shè)計(jì)跨外顯子引物?。
通過(guò)上述步驟和原理,可高效完成RNA逆轉(zhuǎn)錄實(shí)驗(yàn),為后續(xù)PCR或qPCR提供可靠模板?。
注:以上僅供參考,不作為實(shí)際數(shù)據(jù),實(shí)驗(yàn)需嚴(yán)格遵循說(shuō)明或咨詢技術(shù)老師。
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